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那他霉素滴眼液是广谱的抗真菌药物，对深部的真菌，比如曲孢子菌属、芽生菌属、念珠菌属等都有强大的抑制作用，临床上主要用于真菌性眼部感染疾病，比如真菌性角膜炎，首选5%那他霉素滴眼液。因为该眼药水眼内通透性良好，可达到良好的治疗效果，好转以后可以适当的减少用药的频率。如果临床治愈以后，可以考虑维持用药2-4周以防复发。若病情加重，比如合并前房积脓、可疑的眼内炎等，可能还需要联合0.3%氟康唑滴眼液，配合伊曲康唑口服药物治疗甚至及时采取板层或穿透性角膜移植手术治疗。
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